Johann Buxtorf el Joven, orientalista, era hijo de Johann Buxtorf el Viejo. Nació en Basilea el 13 de agosto de 1599 y murió allí el 17 de agosto de 1664.
Johann Buxtorf el JovenTras recibir su primera educación de su padre asistió a la escuela superior de su ciudad natal, yendo en 1617 a Heidelberg donde permaneció dos años, tras lo cual fue a Dort, donde asistió al sínodo. Tras su conclusión hizo una gira por Holanda, Inglaterra y Francia acompañado por delegados de la ciudad, regresando luego a Basilea. A la edad de veintitrés años publicó su Lexicon Chaldaicum et Syriacum (Basilea, 1622), y al año siguiente estudió en Ginebra, declinando un llamamiento para enseñar lógica en Lausana, prefiriendo quedarse en su ciudad natal, donde sirvió como diácono desde 1624 a 1630. Delicado de salud tuvo que abandonar toda esperanza de ser predicador, sucediendo a su padre como profesor de hebreo en 1630. No quiso aceptar las invitaciones de Groningen y Leiden pero en 1654 aceptó la cátedra de exégesis del Antiguo Testamento, al estar estrechamente relacionada con la que ya estaba ejerciendo. Su objetivo fue defender las ideas de su padre sobre la pureza del texto masorético del Antiguo Testamento, contra los muchos ataques, particularmente de Cappel, que minaban la tradición rabínica, considerando al texto hebreo inferior en algunos lugares a las antiguas versiones. Por esta y otras controversias similares escribió De punctorum, vocalium atque accentuum in libris Veteris Testamenti Hebraicis origine, antiquitate et auctoritate (Basilea, 1648) y Anticritica, seu vindiciæ veritatis Hebraicæ adversus Ludovici Cappelli criticam quam sacram vocat (1653), pero aunque la victoria lógica se quedó del lado de Cappel, que pudo apelar al juicio de Elías Levita, quien ejerció una poderosa influencia en el desarrollo de los estudios del Antiguo Testamento entre los protestantes, y también contó con el apoyo de muchos reformadores, finalmente fue considerado un hombre peligroso, porque intentaba negar la divinidad de las Escrituras, mientras que a Buxtorf se le valoró como un defensor de la ortodoxia, ganando el veredicto formal. En una controversia menor con Cappel sobre la eucaristía escribió Vindiciæ exercitationis Sanctæ Coenæ contra Cappellum (Basilea, 1646) y Anticritica contra Cappellum (1653). Asimismo hizo una traducción latina de Moreh Nebukim de Maimónides (Basilea, 1629) y editó, con notas y traducción el Liber Cosri, sive colloquium de religione de Judá ha-Leví (1660).