John Clarke nació probablemente en Suffolk, Inglaterra, el 8 de octubre de 1609 y murió en Newport, Rhode Island, en abril de 1676.
John ClarkeFue un eminente médico que dejó Inglaterra al ser perseguido por separatista, llegando a Boston en noviembre de 1637, en el momento en el que el gobierno de Massachusetts tomaba drásticas medidas contra Anne Hutchinson y John Wheelwright. Ya sea por su simpatía hacia Anne Hutchinson o por su aversión a la intolerancia, corrió la suerte de la facción desterrada, convirtiéndose en dirigente en busca de un asentamiento donde se pudiera disfrutar de libertad de conciencia. Hallando el clima en New Hampshire demasiado severo, la facción dirigida por Clarke y William Coddington logró, por los buenos oficios de Roger Williams, el derecho a asentarse en Rhode Island y en marzo de 1638 los diecinueve miembros masculinos hicieron pacto para someter sus personas, vidas y posesiones al señorío de Jesucristo, haciendo su voluntad según está revelada en las Sagradas Escrituras. Pero guardaron celosamente el principio de la libertad de conciencia al establecer que "nadie será tenido por delincuente por doctrina si no es directamente repugnante al gobierno de leyes establecido." En 1641 la ley que establecía la libertad de conciencia fue reiterada y fortalecida. Clarke tuvo mucho que ver con la unidad de los asentamientos en Rhode Island y Providence por una cédula conseguida por Williams, pudiendo ser él quien elaboró el libro legislativo que proporrciona democracia y libertad de conciencia. Si no era anti-paidobaptista antes de salir de Inglaterra, lo era probablemente ya en 1641 y ciertamente en 1644, cuando Mark Lukar, un anti-paidobaptista, se asoció con él en una iglesia en Newport, de la que Clarke había sido pastor desde 1641. Mientras visitaba Lynn, Massachusetts, en 1651, Clarke y dos colaboradores fueron arrestados y multados y uno de ellos azotado. Entonces Clarke publicó Ill Newes from New England (Londres, 1652), donde vindicaba los principios de libertad de conciencia y bautismo de creyentes. Los siguientes doce años residió en Inglaterra como representante de su colonia. En 1663 obtuvo de Carlos II una cédula que concedía completa libertad religiosa y civil. A la iglesia de Newport deben muchas iglesias bautistas su origen.