Johann Jakob Grynæus, sobrino nieto de Simon Grynæus, nació en Berna el 1 de octubre de 1540 y murió en Basilea el 13 de agosto de 1617.
Johann Jakob GrynæusEstudió en las universidades de Basilea y Tubinga y en 1565 sucedió a su padre en la labor pastoral en Rotelen cerca de Basilea, de donde fue a la ciudad, en 1575, como profesor de Antiguo Testamento en la universidad. En este tiempo abandonó definitivamente sus ideas luteranas sobre la eucaristía. En 1584 le fue encomendado por el elector palatino Juan Casimiro la reorganización de la universidad de Heidelberg, pero regresó a Basilea en 1586 como sucesor de Sulzer en el puesto de presidente (antistes) en la iglesia. Relacionado con ese oficio estaba el deber de pastor en la catedral, presidente del clero de la ciudad, archidiácono del territorio de Basilea y profesor de teología en la universidad. En la historia interna de la iglesia en Basilea su administración es importante y marca la tendencia del movimiento hacia el luteranismo promovido por Sulzer y la asimilación de la doctrina de la iglesia de Basilea con la de las otras iglesias suizas. La Confesión de Basilea de 1534, abandonada por Sulzer, fue publicada de nuevo por Grynæus en 1590. Aunque se quedó ciego en 1612, ello no le impidió continuar sus deberes como pastor y profesor.